При флюорография и рентгенографии используют рентгеновское излучение. Но методы разные. Доза облучения при рентгеновском исследовании несколько ниже, чем при флюорографии. Поэтому детям до 15 лет флюорографию не делают, а взрослым делают не чаще 1 раза в год. Но флюорография более популярна для массовых исследований. Она позволяет получить цифровое изображение и она более дешёвая.
При рентгенографии изображение проявляется на специальной плёнке. При флюорографии изображение проявляется на экране, откуда фотографируется на обычный или цифровой фотоаппарат.

P.S. Часто задают этот вопрос.